PsyMuKB

Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts

Visualization of de novo variants in transcripts

Visualization of original de novo CNV set

There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.

Transcripts

Transcript ID	Transcript exon region	Coding exon region
ENST00000241453	[[28577410, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592603, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674729]]	[[28578188, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592603, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674647]]
ENST00000380982	[[28577413, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592594, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674729]]	[[28578188, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592594, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674647]]
ENST00000380987	[[28577750, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592603, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28599420, 28599552], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674729]]	[[28599539, 28599552], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674647]]
ENST00000537084	[[28577929, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674707]]	[[28578188, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674647]]
ENST00000469894	[[28578083, 28578311], [28583442, 28583627], [28588588, 28588649]]	None
NR_130706	[[28577410, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592603, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28599420, 28599552], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674729]]	None
NM_004119	[[28577410, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592603, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674729]]	[[28578188, 28578311], [28588588, 28588694], [28589293, 28589393], [28589726, 28589838], [28592603, 28592726], [28597486, 28597614], [28598997, 28599080], [28601224, 28601378], [28602314, 28602425], [28608023, 28608128], [28608218, 28608351], [28608437, 28608544], [28609631, 28609810], [28610071, 28610180], [28611321, 28611425], [28622411, 28622580], [28623520, 28623674], [28623771, 28623911], [28624231, 28624359], [28626681, 28626811], [28631483, 28631599], [28636003, 28636206], [28644627, 28644749], [28674604, 28674647]]

Promoter

Chrom	Start	End	Description
chr13	28674672	28674681	CAGE_peak_3_at_FLT3_5end
chr13	28674693	28674747	CAGE_peak_1_at_FLT3_5end

Enhancer

Chrom	Start	End	Genehancer ID	Score	Attributes
chr13	GH13I028015	28015929	28016227	0.24	[{'connected_gene': 'PAN3', 'score': 11.26}, {'connected_gene': 'PLUT', 'score': 10.47}, {'connected_gene': 'PDX1', 'score': 10.47}, {'connected_gene': 'FLT3', 'score': 2.32}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.34}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.23}]
chr13	GH13I028102	28102001	28102200	0.38	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'CHCHD2P8', 'score': 0.44}]
chr13	GH13I028037	28037529	28037671	0.5	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 20.39}, {'connected_gene': 'PAN3', 'score': 1.27}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.31}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.26}]
chr13	GH13I028031	28031245	28032277	0.91	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 30.44}, {'connected_gene': 'PAN3', 'score': 11.37}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.28}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.28}]
chr13	GH13I028041	28041535	28041804	0.47	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 5.79}, {'connected_gene': 'PAN3', 'score': 1.64}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.31}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.25}]
chr13	GH13I028086	28086439	28086542	0.22	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 9.04}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.37}]
chr13	GH13I028098	28098812	28099022	0.44	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 567.4}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.29}]
chr13	GH13I028046	28046665	28051118	1.23	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 12.94}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.37}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.23}]
chr13	GH13I028022	28022413	28023810	0.49	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 30.41}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.31}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.26}]
chr13	GH13I028099	28099421	28101267	1.53	[{'connected_gene': 'FLT3', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'PAN3-AS1', 'score': 5.37}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.29}]
chr13	GH13I027958	27958858	27982215	2	[{'connected_gene': 'CDX2', 'score': 557.17}, {'connected_gene': 'URAD', 'score': 22.79}, {'connected_gene': 'RPL21', 'score': 12.76}, {'connected_gene': 'PLUT', 'score': 12.55}, {'connected_gene': 'PDX1', 'score': 12.54}, {'connected_gene': 'GSX1', 'score': 10.83}, {'connected_gene': 'RN7SL272P', 'score': 10.79}, {'connected_gene': 'LNX2', 'score': 1.62}, {'connected_gene': 'FLT3', 'score': 1.36}, {'connected_gene': 'GC13M027960', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'LOC105370132', 'score': 0.44}]
chr13	GH13I028035	28035264	28035353	0.66	[{'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.29}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.26}, {'connected_gene': 'FLT3', 'score': 0.2}]
chr13	GH13I028066	28066990	28068900	0.31	[{'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'FLT3', 'score': 23.45}]
chr13	GH13I028043	28043201	28043400	0.46	[{'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.34}, {'connected_gene': 'PIR32072', 'score': 0.25}, {'connected_gene': 'FLT3', 'score': 0.22}]
chr13	GH13I028093	28093579	28095000	0.63	[{'connected_gene': 'PAN3-AS1', 'score': 4.49}, {'connected_gene': 'FLT3', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'KATNBL1P1', 'score': 0.31}]