PsyMuKB

Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts

Visualization of de novo variants in transcripts

Visualization of original de novo CNV set

There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.

Transcripts

Transcript ID	Transcript exon region	Coding exon region
ENST00000311528	[[89627064, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89630949]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
ENST00000491523	[[89627084, 89627120], [89627347, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628801]]	None
ENST00000563749	[[89627084, 89629451]]	None
ENST00000484610	[[89627086, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629475]]	None
ENST00000563270	[[89627088, 89627120], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629440]]	[[89628784, 89628799], [89629291, 89629440]]
ENST00000567815	[[89627088, 89627120], [89627361, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629488]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
ENST00000487034	[[89627089, 89627120], [89627347, 89627931]]	None
ENST00000562879	[[89627089, 89627120], [89627347, 89627471], [89628003, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629881]]	[[89627367, 89627471], [89628003, 89628091]]
ENST00000565571	[[89627090, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628257]]	None
ENST00000452368	[[89627090, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628006], [89628147, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89630360]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628006], [89628147, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
ENST00000467736	[[89627118, 89627247], [89627347, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628118]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628118]]
ENST00000393099	[[89627118, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89630950]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
ENST00000399461	[[89627311, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629474]]	None
ENST00000570149	[[89628547, 89628799], [89629291, 89629474]]	None
ENST00000472354	[[89628777, 89628853], [89629291, 89629846]]	[[89628777, 89628853], [89629291, 89629450]]
NM_001243130	[[89627064, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89627737], [89628003, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89633237]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627737], [89628003, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
NM_001243131	[[89627064, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628006], [89628147, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89633237]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628006], [89628147, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
NM_000977	[[89627064, 89627120], [89627347, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89633237]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]
NM_033251	[[89627118, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89633237]]	[[89627367, 89627471], [89627634, 89627776], [89627985, 89628159], [89628742, 89628799], [89629291, 89629450]]

Promoter

Chrom	Start	End	Description
chr16	89627061	89627100	CAGE_peak_1_at_RPL13_5end
chr16	89627312	89627347	CAGE_peak_2_at_RPL13_5end
chr16	89627501	89627510	CAGE_peak_8_at_RPL13_5end
chr16	89627520	89627538	CAGE_peak_7_at_RPL13_5end
chr16	89627544	89627580	CAGE_peak_5_at_RPL13_5end
chr16	89628797	89628803	CAGE_peak_3_at_RPL13_5end