Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts


Visualization of de novo variants in transcripts


Visualization of original de novo CNV set
   There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.
Transcripts
Transcript ID Transcript exon region Coding exon region
ENST00000396838 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297491], [28304566, 28304720], [28305532, 28305670], [28309522, 28309569], [28321638, 28321729], [28321907, 28321972]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000414429 [[28292516, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297491], [28304566, 28304720], [28309522, 28309572], [28321638, 28321729], [28323099, 28323451], [28323822, 28324048]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000426434 [[28294551, 28294631], [28295159, 28295310], [28321638, 28321981]] [[28294551, 28294631], [28295159, 28295310], [28321638, 28321671]]
ENST00000446222 [[28297150, 28297555], [28304566, 28304720], [28321638, 28321729], [28321907, 28321963]] [[28297150, 28297460]]
ENST00000434036 [[28297226, 28297491], [28304566, 28304720], [28321638, 28321729], [28321907, 28321981]] [[28297226, 28297460]]
ENST00000444081 [[28297387, 28297491], [28304566, 28304720], [28305575, 28305670], [28321638, 28321842]] [[28297387, 28297460]]
ENST00000439628 [[28297408, 28297491], [28304566, 28304720], [28321638, 28321981]] [[28297408, 28297460]]
ENST00000476001 [[28304676, 28304720], [28321094, 28321259], [28321638, 28321981]] None
ENST00000481934 [[28292469, 28292583], [28293812, 28294494]] None
ENST00000439158 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297555], [28303606, 28303911]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000446474 [[28292525, 28294631], [28295159, 28295310], [28303606, 28303911]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295214]]
ENST00000344279 [[28292723, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297555], [28303858, 28303942]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000435857 [[28294071, 28294631], [28295159, 28295310], [28303858, 28304152]] [[28294071, 28294631], [28295159, 28295214]]
ENST00000414431 [[28294373, 28294631], [28295159, 28295310], [28300061, 28300170], [28303858, 28303911]] [[28294373, 28294631], [28295159, 28295214]]
ENST00000453745 [[28294512, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297491], [28303858, 28303975]] [[28294512, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000439636 [[28295224, 28295310], [28297079, 28297491], [28303143, 28303228]] [[28295224, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000447021 [[28295248, 28295310], [28297079, 28297491], [28303606, 28303713]] [[28295248, 28295310], [28297079, 28297460]]
ENST00000426756 [[28297140, 28297555], [28304566, 28304720], [28309522, 28309528]] [[28297140, 28297460]]
NM_145909 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297491], [28304566, 28304720], [28305532, 28305670], [28309522, 28309569], [28321638, 28321729], [28321907, 28321972]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
NM_001135215 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297491], [28304566, 28304720], [28309522, 28309572], [28321638, 28321729], [28323099, 28323451], [28323822, 28324048]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
NM_001135216 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297555], [28303606, 28303911]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
NM_001243243 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28303606, 28303911]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295214]]
NM_001243242 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28300061, 28300170], [28303858, 28304152]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295214]]
NM_030899 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297555], [28303858, 28304152]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
NM_001243241 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297491], [28303858, 28304152]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295310], [28297079, 28297460]]
NM_001243244 [[28292513, 28294631], [28295159, 28295310], [28303858, 28304152]] [[28293942, 28294631], [28295159, 28295214]]
Promoter
Chrom Start End Description
chr6 28303901 28303944 CAGE_peak_2_at_ZNF323_5end
chr6 28304275 28304282 CAGE_peak_7_at_ZNF323_5end
chr6 28321811 28321824 CAGE_peak_8_at_ZNF323_5end
chr6 28321827 28321856 CAGE_peak_5_at_ZNF323_5end
chr6 28321909 28321965 CAGE_peak_3_at_ZNF323_5end
chr6 28321971 28321995 CAGE_peak_1_at_ZNF323_5end
chr6 28322004 28322023 CAGE_peak_6_at_ZNF323_5end
chr6 28322041 28322050 CAGE_peak_14_at_ZNF323_5end

© 2018 bmi.sjtu.edu.cn. All rights reserved.
浙ICP备18030141号.