Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts



Visualization of de novo variants in transcripts


Visualization of original de novo CNV set
   There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.

Transcripts
Transcript ID Transcript exon region Coding exon region
ENST00000257197 [[28709198, 28710674], [28710755, 28710801], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742819]] [[28710765, 28710801], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742557]]
ENST00000257198 [[28709198, 28710674], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742819]] [[28710476, 28710674], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742557]]
NM_004948 [[28709198, 28710674], [28710755, 28710801], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742819]] [[28710765, 28710801], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742557]]
NM_024421 [[28709198, 28710674], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742819]] [[28710476, 28710674], [28711556, 28711805], [28712530, 28712652], [28713853, 28714093], [28714534, 28714747], [28719710, 28719853], [28720004, 28720264], [28721961, 28722147], [28723619, 28723754], [28725573, 28725740], [28728460, 28728605], [28734736, 28734892], [28736005, 28736125], [28737333, 28737536], [28739407, 28739492], [28742494, 28742557]]
Promoter
Chrom Start End Description
chr18 28742652 28742696 CAGE_peak_1_at_DSC1_5end
chr18 28742704 28742718 CAGE_peak_3_at_DSC1_5end
chr18 28742813 28742824 CAGE_peak_2_at_DSC1_5end